Les Germanies mai no qüestionaren la institució monàrquica, però, enemistades amb Carles I i perduda quasi tota esperança en ser degollat el líder radical Vicent Peris al març de 1522, féu la seua aparició a Xàtiva l’anomenat rei Encobert. Es presentava com a nét dels Reis Catòlics –apartat de la cort de xicotet i criat per una pastora a Gibraltar–, i es considerava l’enviat de Déu per alliberar el poble agermanat i restaurar la justícia universal. Se li donà mort molt poc després i fou substituït per successius Encoberts clandestins que no aconseguiren revitalitzar la revolta.